Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MIA3Q5JRA6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MIA3Q5JRA6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIA3Q5JRA6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms