Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB2Q5IJ48 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms