Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM259Q4ZIN3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM259Q4ZIN3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms