Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HFEQ30201 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HFEQ30201 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HFEQ30201 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HFEQ30201 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HFEQ30201 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HFEQ30201 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HFEQ30201 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HFEQ30201 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HFEQ30201 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HFEQ30201 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HFEQ30201 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HFEQ30201 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HFEQ30201 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HFEQ30201 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HFEQ30201 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HFEQ30201 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HFEQ30201 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HFEQ30201 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HFEQ30201 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HFEQ30201 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HFEQ30201 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HFEQ30201 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HFEQ30201 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HFEQ30201 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HFEQ30201 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HFEQ30201 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HFEQ30201 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HFEQ30201 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HFEQ30201 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HFEQ30201 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HFEQ30201 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HFEQ30201 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HFEQ30201 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HFEQ30201 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HFEQ30201 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HFEQ30201 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HFEQ30201 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HFEQ30201 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HFEQ30201 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HFEQ30201 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HFEQ30201 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HFEQ30201 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HFEQ30201 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HFEQ30201 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HFEQ30201 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HFEQ30201 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HFEQ30201 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HFEQ30201 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HFEQ30201 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HFEQ30201 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HFEQ30201 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HFEQ30201 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HFEQ30201 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HFEQ30201 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HFEQ30201 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HFEQ30201 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HFEQ30201 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HFEQ30201 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HFEQ30201 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HFEQ30201 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HFEQ30201 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HFEQ30201 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HFEQ30201 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HFEQ30201 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HFEQ30201 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HFEQ30201 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HFEQ30201 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HFEQ30201 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HFEQ30201 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HFEQ30201 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HFEQ30201 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HFEQ30201 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HFEQ30201 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HFEQ30201 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HFEQ30201 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HFEQ30201 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HFEQ30201 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HFEQ30201 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HFEQ30201 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HFEQ30201 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HFEQ30201 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HFEQ30201 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HFEQ30201 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HFEQ30201 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HFEQ30201 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HFEQ30201 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HFEQ30201 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HFEQ30201 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HFEQ30201 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HFEQ30201 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HFEQ30201 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HFEQ30201 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HFEQ30201 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HFEQ30201 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HFEQ30201 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HFEQ30201 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HFEQ30201 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HFEQ30201 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HFEQ30201 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms