Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY1Q16526 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRY1Q16526 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms