Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SF3B3Q15393 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SF3B3Q15393 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SF3B3Q15393 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
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