Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMCO1Q147U7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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