Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF3Q14653 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF3Q14653 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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