Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53BQ14153 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53BQ14153 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53BQ14153 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53BQ14153 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53BQ14153 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53BQ14153 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53BQ14153 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53BQ14153 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53BQ14153 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53BQ14153 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53BQ14153 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53BQ14153 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53BQ14153 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53BQ14153 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53BQ14153 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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