Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMAD4Q13485 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD4Q13485 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD4Q13485 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
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