Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPA4Q13156 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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