Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TARDBPQ13148 MAPK8-209ENST00000429041 603 ntTSL 510.9□□□□□ -0.662e-9■■■■■ 36.3
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TARDBPQ13148 MAPK8-215ENST00000476134 732 ntTSL 35.89□□□□□ -1.472e-9■■■■■ 36.3
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TARDBPQ13148 RAB5A-207ENST00000473608 868 ntTSL 25.24□□□□□ -1.574e-8■■■■■ 36.3
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TARDBPQ13148 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.058e-7■■■■■ 35.9
TARDBPQ13148 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 35.9
TARDBPQ13148 CNOT8-203ENST00000517568 692 ntTSL 414.35□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 35.9
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TARDBPQ13148 CNOT8-212ENST00000519903 648 ntTSL 413.28□□□□□ -0.288e-7■■■■■ 35.9
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TARDBPQ13148 SLC12A4-212ENST00000573023 3649 ntTSL 518.04■□□□□ 0.487e-10■■■■■ 35.9
TARDBPQ13148 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.447e-10■■■■■ 35.9
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TARDBPQ13148 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.585e-14■■■■■ 35.8
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