Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C1Q12789 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3C1Q12789 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF3C1Q12789 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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