Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL7P80098 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL7P80098 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL7P80098 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL7P80098 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL7P80098 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL7P80098 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL7P80098 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL7P80098 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL7P80098 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL7P80098 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL7P80098 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL7P80098 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL7P80098 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL7P80098 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL7P80098 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL7P80098 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL7P80098 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL7P80098 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL7P80098 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL7P80098 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL7P80098 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL7P80098 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL7P80098 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL7P80098 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCL7P80098 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCL7P80098 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL7P80098 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL7P80098 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL7P80098 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL7P80098 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL7P80098 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL7P80098 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL7P80098 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL7P80098 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL7P80098 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL7P80098 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL7P80098 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL7P80098 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL7P80098 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL7P80098 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL7P80098 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL7P80098 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL7P80098 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL7P80098 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL7P80098 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL7P80098 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL7P80098 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL7P80098 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL7P80098 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL7P80098 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL7P80098 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL7P80098 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL7P80098 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL7P80098 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL7P80098 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL7P80098 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL7P80098 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL7P80098 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL7P80098 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL7P80098 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL7P80098 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL7P80098 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL7P80098 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL7P80098 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL7P80098 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL7P80098 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL7P80098 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL7P80098 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL7P80098 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL7P80098 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL7P80098 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL7P80098 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL7P80098 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL7P80098 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL7P80098 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL7P80098 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL7P80098 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL7P80098 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL7P80098 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL7P80098 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL7P80098 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL7P80098 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL7P80098 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL7P80098 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL7P80098 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL7P80098 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL7P80098 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL7P80098 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL7P80098 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL7P80098 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL7P80098 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL7P80098 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL7P80098 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL7P80098 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL7P80098 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL7P80098 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL7P80098 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL7P80098 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL7P80098 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.2 ms