Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVPABLB-1P60509 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVPABLB-1P60509 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms