Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNB3P54284 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNB3P54284 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB3P54284 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms