Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX5P50542 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX5P50542 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX5P50542 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX5P50542 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX5P50542 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX5P50542 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX5P50542 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX5P50542 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX5P50542 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX5P50542 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX5P50542 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX5P50542 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX5P50542 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX5P50542 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX5P50542 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX5P50542 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX5P50542 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PEX5P50542 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PEX5P50542 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PEX5P50542 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PEX5P50542 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PEX5P50542 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PEX5P50542 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PEX5P50542 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PEX5P50542 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX5P50542 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX5P50542 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX5P50542 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX5P50542 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX5P50542 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX5P50542 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX5P50542 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX5P50542 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX5P50542 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX5P50542 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX5P50542 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX5P50542 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX5P50542 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX5P50542 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX5P50542 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX5P50542 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX5P50542 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX5P50542 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX5P50542 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX5P50542 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX5P50542 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX5P50542 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX5P50542 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX5P50542 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX5P50542 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX5P50542 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX5P50542 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX5P50542 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX5P50542 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX5P50542 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX5P50542 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX5P50542 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX5P50542 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX5P50542 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX5P50542 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX5P50542 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX5P50542 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PEX5P50542 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PEX5P50542 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PEX5P50542 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX5P50542 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX5P50542 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX5P50542 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX5P50542 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX5P50542 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX5P50542 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX5P50542 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX5P50542 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX5P50542 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX5P50542 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX5P50542 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX5P50542 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX5P50542 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX5P50542 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX5P50542 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX5P50542 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX5P50542 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX5P50542 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX5P50542 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX5P50542 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX5P50542 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX5P50542 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX5P50542 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX5P50542 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX5P50542 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX5P50542 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX5P50542 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX5P50542 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX5P50542 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX5P50542 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX5P50542 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX5P50542 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX5P50542 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX5P50542 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms