Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PEX5P50542 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PEX5P50542 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PEX5P50542 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PEX5P50542 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PEX5P50542 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PEX5P50542 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PEX5P50542 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PEX5P50542 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PEX5P50542 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PEX5P50542 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PEX5P50542 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PEX5P50542 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PEX5P50542 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PEX5P50542 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PEX5P50542 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PEX5P50542 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PEX5P50542 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PEX5P50542 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PEX5P50542 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PEX5P50542 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PEX5P50542 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PEX5P50542 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PEX5P50542 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PEX5P50542 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PEX5P50542 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PEX5P50542 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PEX5P50542 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PEX5P50542 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PEX5P50542 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PEX5P50542 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PEX5P50542 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PEX5P50542 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PEX5P50542 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PEX5P50542 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PEX5P50542 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PEX5P50542 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PEX5P50542 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PEX5P50542 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PEX5P50542 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PEX5P50542 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PEX5P50542 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PEX5P50542 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PEX5P50542 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PEX5P50542 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PEX5P50542 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PEX5P50542 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PEX5P50542 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PEX5P50542 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PEX5P50542 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PEX5P50542 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PEX5P50542 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PEX5P50542 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PEX5P50542 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PEX5P50542 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PEX5P50542 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PEX5P50542 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PEX5P50542 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PEX5P50542 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PEX5P50542 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PEX5P50542 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PEX5P50542 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PEX5P50542 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PEX5P50542 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PEX5P50542 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PEX5P50542 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PEX5P50542 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PEX5P50542 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PEX5P50542 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PEX5P50542 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PEX5P50542 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PEX5P50542 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PEX5P50542 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PEX5P50542 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PEX5P50542 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PEX5P50542 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PEX5P50542 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PEX5P50542 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PEX5P50542 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PEX5P50542 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PEX5P50542 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PEX5P50542 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PEX5P50542 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PEX5P50542 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PEX5P50542 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PEX5P50542 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PEX5P50542 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PEX5P50542 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PEX5P50542 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PEX5P50542 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PEX5P50542 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PEX5P50542 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PEX5P50542 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PEX5P50542 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PEX5P50542 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PEX5P50542 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PEX5P50542 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PEX5P50542 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PEX5P50542 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PEX5P50542 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms