Protein–RNA interactions for Protein: P49821

NDUFV1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV1P49821 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDUFV1P49821 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFV1P49821 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDUFV1P49821 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDUFV1P49821 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDUFV1P49821 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDUFV1P49821 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDUFV1P49821 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NDUFV1P49821 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDUFV1P49821 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDUFV1P49821 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDUFV1P49821 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFV1P49821 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFV1P49821 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFV1P49821 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFV1P49821 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFV1P49821 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms