Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD2P49005 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD2P49005 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD2P49005 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD2P49005 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD2P49005 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD2P49005 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD2P49005 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD2P49005 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD2P49005 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD2P49005 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD2P49005 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD2P49005 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD2P49005 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD2P49005 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD2P49005 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD2P49005 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD2P49005 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD2P49005 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD2P49005 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD2P49005 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD2P49005 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD2P49005 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD2P49005 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD2P49005 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD2P49005 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD2P49005 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD2P49005 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD2P49005 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD2P49005 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD2P49005 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD2P49005 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD2P49005 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD2P49005 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD2P49005 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD2P49005 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD2P49005 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD2P49005 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD2P49005 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD2P49005 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD2P49005 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD2P49005 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD2P49005 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD2P49005 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD2P49005 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD2P49005 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD2P49005 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD2P49005 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD2P49005 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD2P49005 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLD2P49005 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLD2P49005 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLD2P49005 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD2P49005 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD2P49005 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD2P49005 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD2P49005 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD2P49005 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD2P49005 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD2P49005 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD2P49005 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD2P49005 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD2P49005 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD2P49005 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD2P49005 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD2P49005 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD2P49005 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD2P49005 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD2P49005 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD2P49005 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD2P49005 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD2P49005 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD2P49005 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD2P49005 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD2P49005 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD2P49005 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD2P49005 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD2P49005 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD2P49005 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD2P49005 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD2P49005 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD2P49005 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD2P49005 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD2P49005 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD2P49005 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD2P49005 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD2P49005 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLD2P49005 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLD2P49005 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD2P49005 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD2P49005 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD2P49005 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD2P49005 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD2P49005 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD2P49005 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD2P49005 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD2P49005 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD2P49005 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD2P49005 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD2P49005 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms