Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRA4P48169 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms