Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGER4P35408 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER4P35408 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGER4P35408 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGER4P35408 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGER4P35408 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGER4P35408 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGER4P35408 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms