Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LTKP29376 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
LTKP29376 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
LTKP29376 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LTKP29376 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LTKP29376 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LTKP29376 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LTKP29376 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LTKP29376 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LTKP29376 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
LTKP29376 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LTKP29376 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LTKP29376 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LTKP29376 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
LTKP29376 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LTKP29376 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LTKP29376 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LTKP29376 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LTKP29376 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LTKP29376 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LTKP29376 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LTKP29376 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LTKP29376 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
LTKP29376 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LTKP29376 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LTKP29376 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LTKP29376 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LTKP29376 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LTKP29376 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LTKP29376 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LTKP29376 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LTKP29376 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LTKP29376 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LTKP29376 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LTKP29376 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LTKP29376 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LTKP29376 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
LTKP29376 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LTKP29376 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LTKP29376 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LTKP29376 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LTKP29376 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LTKP29376 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
LTKP29376 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LTKP29376 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LTKP29376 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LTKP29376 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LTKP29376 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LTKP29376 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LTKP29376 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LTKP29376 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LTKP29376 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
LTKP29376 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
LTKP29376 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LTKP29376 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LTKP29376 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LTKP29376 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LTKP29376 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LTKP29376 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LTKP29376 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LTKP29376 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LTKP29376 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LTKP29376 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LTKP29376 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LTKP29376 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LTKP29376 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
LTKP29376 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LTKP29376 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
LTKP29376 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LTKP29376 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LTKP29376 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LTKP29376 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LTKP29376 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LTKP29376 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LTKP29376 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LTKP29376 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LTKP29376 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LTKP29376 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LTKP29376 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LTKP29376 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
LTKP29376 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LTKP29376 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LTKP29376 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LTKP29376 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
LTKP29376 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LTKP29376 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LTKP29376 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LTKP29376 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LTKP29376 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LTKP29376 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LTKP29376 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LTKP29376 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LTKP29376 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LTKP29376 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LTKP29376 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LTKP29376 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LTKP29376 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LTKP29376 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LTKP29376 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
LTKP29376 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms