Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-DMAP28067 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms