Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD27P26842 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD27P26842 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD27P26842 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD27P26842 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD27P26842 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD27P26842 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD27P26842 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD27P26842 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD27P26842 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD27P26842 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD27P26842 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD27P26842 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD27P26842 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD27P26842 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD27P26842 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD27P26842 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD27P26842 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD27P26842 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD27P26842 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD27P26842 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD27P26842 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD27P26842 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD27P26842 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD27P26842 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD27P26842 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD27P26842 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD27P26842 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD27P26842 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD27P26842 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD27P26842 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD27P26842 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD27P26842 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD27P26842 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD27P26842 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD27P26842 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD27P26842 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CD27P26842 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD27P26842 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD27P26842 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD27P26842 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD27P26842 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD27P26842 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD27P26842 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD27P26842 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD27P26842 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD27P26842 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD27P26842 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD27P26842 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD27P26842 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD27P26842 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD27P26842 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD27P26842 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD27P26842 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD27P26842 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD27P26842 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD27P26842 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD27P26842 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD27P26842 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD27P26842 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD27P26842 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD27P26842 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD27P26842 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD27P26842 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CD27P26842 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD27P26842 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD27P26842 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD27P26842 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD27P26842 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD27P26842 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD27P26842 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CD27P26842 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD27P26842 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD27P26842 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD27P26842 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD27P26842 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD27P26842 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD27P26842 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD27P26842 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD27P26842 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD27P26842 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD27P26842 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD27P26842 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD27P26842 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD27P26842 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms