Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP11P24347 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP11P24347 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP11P24347 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP11P24347 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP11P24347 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP11P24347 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP11P24347 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP11P24347 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP11P24347 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP11P24347 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP11P24347 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP11P24347 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP11P24347 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP11P24347 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP11P24347 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP11P24347 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP11P24347 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MMP11P24347 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP11P24347 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP11P24347 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP11P24347 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP11P24347 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP11P24347 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP11P24347 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP11P24347 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP11P24347 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP11P24347 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP11P24347 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP11P24347 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP11P24347 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP11P24347 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP11P24347 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP11P24347 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP11P24347 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP11P24347 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP11P24347 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP11P24347 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP11P24347 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP11P24347 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP11P24347 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP11P24347 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP11P24347 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP11P24347 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP11P24347 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP11P24347 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP11P24347 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP11P24347 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP11P24347 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP11P24347 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP11P24347 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP11P24347 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP11P24347 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP11P24347 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP11P24347 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP11P24347 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP11P24347 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP11P24347 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP11P24347 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP11P24347 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP11P24347 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP11P24347 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MMP11P24347 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP11P24347 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP11P24347 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP11P24347 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP11P24347 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP11P24347 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP11P24347 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP11P24347 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP11P24347 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP11P24347 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP11P24347 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP11P24347 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP11P24347 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP11P24347 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP11P24347 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP11P24347 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP11P24347 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP11P24347 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP11P24347 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP11P24347 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP11P24347 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP11P24347 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP11P24347 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP11P24347 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP11P24347 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP11P24347 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP11P24347 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP11P24347 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP11P24347 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP11P24347 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP11P24347 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP11P24347 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP11P24347 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP11P24347 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP11P24347 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP11P24347 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP11P24347 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP11P24347 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms