Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2B4P23634 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2B4P23634 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2B4P23634 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms