Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.7
PTPRGP23470 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
PTPRGP23470 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTPRGP23470 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRGP23470 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PTPRGP23470 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms