Protein–RNA interactions for Protein: P20062

TCN2, Transcobalamin-2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN2P20062 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCN2P20062 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCN2P20062 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCN2P20062 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCN2P20062 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCN2P20062 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCN2P20062 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN2P20062 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN2P20062 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN2P20062 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN2P20062 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN2P20062 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN2P20062 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN2P20062 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN2P20062 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCN2P20062 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TCN2P20062 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCN2P20062 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCN2P20062 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCN2P20062 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCN2P20062 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCN2P20062 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCN2P20062 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN2P20062 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN2P20062 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN2P20062 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN2P20062 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN2P20062 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN2P20062 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN2P20062 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN2P20062 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCN2P20062 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCN2P20062 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCN2P20062 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCN2P20062 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCN2P20062 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCN2P20062 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCN2P20062 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN2P20062 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN2P20062 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN2P20062 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN2P20062 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN2P20062 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCN2P20062 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCN2P20062 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCN2P20062 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCN2P20062 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCN2P20062 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCN2P20062 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCN2P20062 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN2P20062 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN2P20062 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN2P20062 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN2P20062 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN2P20062 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN2P20062 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN2P20062 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN2P20062 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN2P20062 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN2P20062 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN2P20062 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN2P20062 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN2P20062 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN2P20062 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCN2P20062 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCN2P20062 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCN2P20062 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN2P20062 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN2P20062 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN2P20062 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN2P20062 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN2P20062 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN2P20062 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN2P20062 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN2P20062 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN2P20062 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN2P20062 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN2P20062 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN2P20062 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN2P20062 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN2P20062 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN2P20062 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCN2P20062 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCN2P20062 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCN2P20062 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCN2P20062 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCN2P20062 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCN2P20062 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCN2P20062 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCN2P20062 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCN2P20062 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCN2P20062 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCN2P20062 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCN2P20062 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCN2P20062 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCN2P20062 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCN2P20062 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCN2P20062 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCN2P20062 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCN2P20062 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms