Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATF3P18847 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATF3P18847 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATF3P18847 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATF3P18847 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATF3P18847 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATF3P18847 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATF3P18847 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATF3P18847 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATF3P18847 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATF3P18847 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATF3P18847 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATF3P18847 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ATF3P18847 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATF3P18847 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ATF3P18847 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATF3P18847 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
ATF3P18847 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATF3P18847 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATF3P18847 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATF3P18847 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ATF3P18847 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATF3P18847 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATF3P18847 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATF3P18847 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATF3P18847 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATF3P18847 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ATF3P18847 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATF3P18847 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATF3P18847 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATF3P18847 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATF3P18847 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATF3P18847 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATF3P18847 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATF3P18847 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATF3P18847 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATF3P18847 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATF3P18847 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATF3P18847 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATF3P18847 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATF3P18847 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATF3P18847 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATF3P18847 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATF3P18847 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATF3P18847 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATF3P18847 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATF3P18847 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATF3P18847 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATF3P18847 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATF3P18847 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATF3P18847 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATF3P18847 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATF3P18847 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATF3P18847 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATF3P18847 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATF3P18847 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ATF3P18847 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATF3P18847 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATF3P18847 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATF3P18847 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ATF3P18847 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATF3P18847 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATF3P18847 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATF3P18847 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATF3P18847 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATF3P18847 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
ATF3P18847 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATF3P18847 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATF3P18847 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATF3P18847 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATF3P18847 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ATF3P18847 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATF3P18847 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATF3P18847 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATF3P18847 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATF3P18847 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATF3P18847 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATF3P18847 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATF3P18847 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
ATF3P18847 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATF3P18847 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
ATF3P18847 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATF3P18847 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATF3P18847 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATF3P18847 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATF3P18847 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATF3P18847 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATF3P18847 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATF3P18847 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATF3P18847 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATF3P18847 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATF3P18847 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATF3P18847 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
ATF3P18847 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATF3P18847 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATF3P18847 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATF3P18847 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATF3P18847 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATF3P18847 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATF3P18847 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms