Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN2P17706 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN2P17706 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN2P17706 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN2P17706 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN2P17706 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms