Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB2P14652 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXB2P14652 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB2P14652 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms