Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOP08100 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOP08100 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOP08100 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOP08100 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOP08100 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOP08100 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOP08100 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOP08100 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOP08100 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOP08100 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOP08100 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOP08100 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOP08100 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOP08100 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOP08100 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHOP08100 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOP08100 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOP08100 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOP08100 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOP08100 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOP08100 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOP08100 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOP08100 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOP08100 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOP08100 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOP08100 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOP08100 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOP08100 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOP08100 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOP08100 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOP08100 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOP08100 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOP08100 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOP08100 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOP08100 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOP08100 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOP08100 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOP08100 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOP08100 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOP08100 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOP08100 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOP08100 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOP08100 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOP08100 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOP08100 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOP08100 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOP08100 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOP08100 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOP08100 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOP08100 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOP08100 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOP08100 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOP08100 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOP08100 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOP08100 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOP08100 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOP08100 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOP08100 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOP08100 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOP08100 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOP08100 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOP08100 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOP08100 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOP08100 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOP08100 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOP08100 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOP08100 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOP08100 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOP08100 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOP08100 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOP08100 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOP08100 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOP08100 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOP08100 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOP08100 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOP08100 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOP08100 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOP08100 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOP08100 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOP08100 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOP08100 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOP08100 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOP08100 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOP08100 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOP08100 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOP08100 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOP08100 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOP08100 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOP08100 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOP08100 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOP08100 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOP08100 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOP08100 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOP08100 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOP08100 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOP08100 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOP08100 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOP08100 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOP08100 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms