Protein–RNA interactions for Protein: P04629

NTRK1, High affinity nerve growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK1P04629 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK1P04629 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK1P04629 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms