Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
A1BGP04217 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
A1BGP04217 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
A1BGP04217 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
A1BGP04217 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
A1BGP04217 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
A1BGP04217 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
A1BGP04217 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
A1BGP04217 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
A1BGP04217 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
A1BGP04217 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
A1BGP04217 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
A1BGP04217 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
A1BGP04217 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
A1BGP04217 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
A1BGP04217 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
A1BGP04217 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
A1BGP04217 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
A1BGP04217 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
A1BGP04217 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
A1BGP04217 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
A1BGP04217 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
A1BGP04217 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
A1BGP04217 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
A1BGP04217 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
A1BGP04217 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
A1BGP04217 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
A1BGP04217 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
A1BGP04217 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
A1BGP04217 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
A1BGP04217 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
A1BGP04217 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
A1BGP04217 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
A1BGP04217 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
A1BGP04217 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
A1BGP04217 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
A1BGP04217 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
A1BGP04217 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
A1BGP04217 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
A1BGP04217 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
A1BGP04217 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
A1BGP04217 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
A1BGP04217 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
A1BGP04217 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
A1BGP04217 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
A1BGP04217 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
A1BGP04217 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
A1BGP04217 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
A1BGP04217 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
A1BGP04217 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
A1BGP04217 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
A1BGP04217 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
A1BGP04217 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
A1BGP04217 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
A1BGP04217 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
A1BGP04217 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
A1BGP04217 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
A1BGP04217 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
A1BGP04217 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
A1BGP04217 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
A1BGP04217 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
A1BGP04217 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
A1BGP04217 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
A1BGP04217 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
A1BGP04217 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
A1BGP04217 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
A1BGP04217 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
A1BGP04217 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
A1BGP04217 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
A1BGP04217 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
A1BGP04217 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
A1BGP04217 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
A1BGP04217 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
A1BGP04217 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
A1BGP04217 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
A1BGP04217 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
A1BGP04217 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
A1BGP04217 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
A1BGP04217 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
A1BGP04217 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
A1BGP04217 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
A1BGP04217 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
A1BGP04217 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
A1BGP04217 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
A1BGP04217 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
A1BGP04217 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
A1BGP04217 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
A1BGP04217 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
A1BGP04217 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
A1BGP04217 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
A1BGP04217 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
A1BGP04217 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
A1BGP04217 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
A1BGP04217 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
A1BGP04217 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
A1BGP04217 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
A1BGP04217 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
A1BGP04217 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
A1BGP04217 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
A1BGP04217 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms