Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCELO95171 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCELO95171 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCELO95171 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCELO95171 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCELO95171 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCELO95171 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCELO95171 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCELO95171 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCELO95171 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCELO95171 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCELO95171 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCELO95171 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCELO95171 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCELO95171 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCELO95171 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCELO95171 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCELO95171 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCELO95171 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCELO95171 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCELO95171 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCELO95171 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCELO95171 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCELO95171 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCELO95171 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCELO95171 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCELO95171 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCELO95171 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCELO95171 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCELO95171 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCELO95171 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCELO95171 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCELO95171 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCELO95171 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCELO95171 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCELO95171 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCELO95171 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCELO95171 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCELO95171 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCELO95171 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCELO95171 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCELO95171 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCELO95171 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCELO95171 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCELO95171 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCELO95171 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCELO95171 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCELO95171 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCELO95171 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCELO95171 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCELO95171 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCELO95171 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCELO95171 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCELO95171 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCELO95171 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCELO95171 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCELO95171 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCELO95171 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCELO95171 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCELO95171 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCELO95171 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCELO95171 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCELO95171 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCELO95171 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCELO95171 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCELO95171 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCELO95171 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCELO95171 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCELO95171 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCELO95171 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCELO95171 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCELO95171 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCELO95171 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCELO95171 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCELO95171 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCELO95171 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCELO95171 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCELO95171 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCELO95171 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCELO95171 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCELO95171 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCELO95171 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCELO95171 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCELO95171 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCELO95171 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCELO95171 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCELO95171 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCELO95171 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCELO95171 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCELO95171 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCELO95171 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCELO95171 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCELO95171 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCELO95171 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCELO95171 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCELO95171 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCELO95171 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCELO95171 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCELO95171 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCELO95171 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms