Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF10O60809 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms