Protein–RNA interactions for Protein: O43491

EPB41L2, Band 4.1-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L2O43491 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPB41L2O43491 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPB41L2O43491 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L2O43491 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms