Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASA4O43374 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASA4O43374 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASA4O43374 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RASA4O43374 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASA4O43374 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASA4O43374 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASA4O43374 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASA4O43374 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASA4O43374 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASA4O43374 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASA4O43374 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASA4O43374 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASA4O43374 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASA4O43374 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASA4O43374 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASA4O43374 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASA4O43374 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASA4O43374 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASA4O43374 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RASA4O43374 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASA4O43374 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASA4O43374 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASA4O43374 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASA4O43374 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASA4O43374 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASA4O43374 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASA4O43374 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASA4O43374 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASA4O43374 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASA4O43374 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASA4O43374 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASA4O43374 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASA4O43374 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASA4O43374 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RASA4O43374 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASA4O43374 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASA4O43374 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASA4O43374 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASA4O43374 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASA4O43374 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASA4O43374 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RASA4O43374 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASA4O43374 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASA4O43374 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASA4O43374 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASA4O43374 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASA4O43374 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASA4O43374 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASA4O43374 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASA4O43374 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASA4O43374 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASA4O43374 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA4O43374 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA4O43374 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA4O43374 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA4O43374 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA4O43374 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA4O43374 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA4O43374 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA4O43374 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA4O43374 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA4O43374 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA4O43374 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA4O43374 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA4O43374 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA4O43374 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA4O43374 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA4O43374 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA4O43374 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA4O43374 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASA4O43374 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RASA4O43374 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RASA4O43374 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASA4O43374 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASA4O43374 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASA4O43374 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA4O43374 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA4O43374 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA4O43374 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA4O43374 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA4O43374 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA4O43374 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA4O43374 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA4O43374 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA4O43374 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA4O43374 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA4O43374 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA4O43374 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA4O43374 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA4O43374 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA4O43374 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA4O43374 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA4O43374 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA4O43374 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA4O43374 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA4O43374 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA4O43374 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA4O43374 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA4O43374 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms