Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
FANCAO15360 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
FANCAO15360 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
FANCAO15360 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
FANCAO15360 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
FANCAO15360 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
FANCAO15360 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
FANCAO15360 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
FANCAO15360 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
FANCAO15360 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
FANCAO15360 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
FANCAO15360 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
FANCAO15360 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCAO15360 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCAO15360 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCAO15360 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
FANCAO15360 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FANCAO15360 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FANCAO15360 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FANCAO15360 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
FANCAO15360 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCAO15360 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCAO15360 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCAO15360 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCAO15360 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCAO15360 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCAO15360 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
FANCAO15360 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
FANCAO15360 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
FANCAO15360 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
FANCAO15360 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
FANCAO15360 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCAO15360 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCAO15360 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCAO15360 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCAO15360 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCAO15360 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCAO15360 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCAO15360 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
FANCAO15360 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
FANCAO15360 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
FANCAO15360 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
FANCAO15360 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCAO15360 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCAO15360 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCAO15360 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCAO15360 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCAO15360 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCAO15360 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCAO15360 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCAO15360 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCAO15360 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCAO15360 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCAO15360 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCAO15360 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FANCAO15360 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
FANCAO15360 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FANCAO15360 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
FANCAO15360 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FANCAO15360 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FANCAO15360 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
FANCAO15360 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FANCAO15360 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
FANCAO15360 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
FANCAO15360 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
FANCAO15360 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
FANCAO15360 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
FANCAO15360 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
FANCAO15360 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FANCAO15360 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
FANCAO15360 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
FANCAO15360 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
FANCAO15360 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
FANCAO15360 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
FANCAO15360 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
FANCAO15360 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
FANCAO15360 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
FANCAO15360 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
FANCAO15360 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
FANCAO15360 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
FANCAO15360 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
FANCAO15360 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
FANCAO15360 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
FANCAO15360 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
FANCAO15360 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
FANCAO15360 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
FANCAO15360 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
FANCAO15360 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FANCAO15360 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FANCAO15360 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FANCAO15360 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FANCAO15360 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
FANCAO15360 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
FANCAO15360 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
FANCAO15360 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
FANCAO15360 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
FANCAO15360 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
FANCAO15360 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
FANCAO15360 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
FANCAO15360 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms