Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POTEFA5A3E0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.55■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.55■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.55■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
POTEFA5A3E0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEFA5A3E0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms