Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GINS2Q9Y248 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS2Q9Y248 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms