Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VSIG2Q96IQ7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms