Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSIG2Q96IQ7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSIG2Q96IQ7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG2Q96IQ7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VSIG2Q96IQ7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSIG2Q96IQ7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG2Q96IQ7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG2Q96IQ7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSIG2Q96IQ7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSIG2Q96IQ7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG2Q96IQ7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG2Q96IQ7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG2Q96IQ7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSIG2Q96IQ7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG2Q96IQ7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSIG2Q96IQ7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG2Q96IQ7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG2Q96IQ7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG2Q96IQ7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG2Q96IQ7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG2Q96IQ7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG2Q96IQ7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG2Q96IQ7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG2Q96IQ7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG2Q96IQ7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSIG2Q96IQ7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSIG2Q96IQ7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSIG2Q96IQ7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSIG2Q96IQ7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSIG2Q96IQ7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSIG2Q96IQ7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VSIG2Q96IQ7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSIG2Q96IQ7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSIG2Q96IQ7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSIG2Q96IQ7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSIG2Q96IQ7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VSIG2Q96IQ7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VSIG2Q96IQ7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VSIG2Q96IQ7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSIG2Q96IQ7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSIG2Q96IQ7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSIG2Q96IQ7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSIG2Q96IQ7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSIG2Q96IQ7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSIG2Q96IQ7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSIG2Q96IQ7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSIG2Q96IQ7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSIG2Q96IQ7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSIG2Q96IQ7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
VSIG2Q96IQ7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSIG2Q96IQ7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VSIG2Q96IQ7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSIG2Q96IQ7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VSIG2Q96IQ7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VSIG2Q96IQ7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSIG2Q96IQ7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSIG2Q96IQ7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VSIG2Q96IQ7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VSIG2Q96IQ7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VSIG2Q96IQ7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VSIG2Q96IQ7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VSIG2Q96IQ7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VSIG2Q96IQ7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VSIG2Q96IQ7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VSIG2Q96IQ7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VSIG2Q96IQ7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VSIG2Q96IQ7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VSIG2Q96IQ7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VSIG2Q96IQ7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VSIG2Q96IQ7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VSIG2Q96IQ7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VSIG2Q96IQ7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VSIG2Q96IQ7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VSIG2Q96IQ7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VSIG2Q96IQ7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VSIG2Q96IQ7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VSIG2Q96IQ7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VSIG2Q96IQ7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VSIG2Q96IQ7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VSIG2Q96IQ7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VSIG2Q96IQ7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VSIG2Q96IQ7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VSIG2Q96IQ7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VSIG2Q96IQ7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VSIG2Q96IQ7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VSIG2Q96IQ7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VSIG2Q96IQ7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VSIG2Q96IQ7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSIG2Q96IQ7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VSIG2Q96IQ7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VSIG2Q96IQ7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VSIG2Q96IQ7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VSIG2Q96IQ7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG2Q96IQ7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VSIG2Q96IQ7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSIG2Q96IQ7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSIG2Q96IQ7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSIG2Q96IQ7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSIG2Q96IQ7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VSIG2Q96IQ7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms