Protein–RNA interactions for Protein: Q93077

HIST1H2AC, Histone H2A type 1-C, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2ACQ93077 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST1H2ACQ93077 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H2ACQ93077 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms