Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM25Q86YD3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM25Q86YD3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms