Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX10Q12887 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX10Q12887 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX10Q12887 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms