Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms