Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms