Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBNO2Q9Y2G9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBNO2Q9Y2G9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms